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转录组学测序解析难治性高血压基因表达特征及核心差异基因

2025-07-09 14:26:05来源:遗传

难治性高血压(resistant hypertension, RH)是高血压疾病谱中危险类型之一,发病机制复杂一直是心血管治疗领域的一大难题。RH的诊断与治疗开辟新的研究视角与干预手段,是该领域亟待解决的键科学问题。

202574日,山东中医药大学杨雯晴课题组在《遗传》杂志上发表了题为转录组学测序解析难治性高血压基因表达特征及核心差异基因”的论文。该研究对收集自医院的30份血液样本(10例高血压患者、10RH患者、10名健康对照者)进行了转录组测序。利用DESeq2分析筛选出731个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),并通过加权基因共表达网络分析鉴定出2个与RH显著相关的模块(含1,944个基因)。将模块基因DEGs取交集获得229个关键DEGs。基因本体(Gene Ontology, GO)分析显示,这些关键DEGs显著富集于药物分解代谢过程、血红蛋白复合体、过氧化物酶活性等条目;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析表明,这些DEGsVEGF信号通路和线粒体自噬等通路相关。进一步构建蛋白质-蛋白质互作(protein-protein interaction, PPI)网络,并运用Cytoscape软件的cytohubba插件整合12种算法筛选核心基因(取各算法前20名基因交集),初步确定GATA1EPB42ANK1SNCA为核心差异基因。 qRT-PCR验证结果证实GATA1EPB42的表达变化与测序结果一致。该研究表明,RH的发生涉及多基因协同作用,核心基因(如GATA1EPB42)及相关通路(如VEGF信号通路、线粒体自噬)的扰动可能在疾病进程中发挥重要作用,这为深入理解RH的病理机制提供了新线索。

 

 

 

 

WGCNA识别关键模块及候选差异基因的鉴定

AB:软阈值筛选的结果图;C: WGCNA聚类树状结构图;D:WGCNA聚类模块相关性热图。左边三角形为相关系数,右边三角形为P值;E: DEGs与紫色、黄绿色模块中的基因韦恩图。

山东中医药大学中医药创新研究院杨雯晴副教授为论文通讯作者,山东中医药大学中医药创新研究院硕士研究生姜彤为论文第一作者。该研究得到山东省自然科学基金重点项目和中国博士后科学基金项目资助。

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