但是，有时候癌症患者在初次基因检测中发现了驱动基因突变，并通过靶向治疗取了显著的效果。但在后续的二次基因检测中，患者可能会发现之前的突变消失，甚至可能出现了其他基因突变。
这是为什么呢？
肿瘤异质性
肿瘤异质性表现为同一种恶性肿瘤在不同患者之间或者同一患者不同部位的肿瘤细胞之间存在着分子差异。
基于肿瘤发生和发展的复杂性，异质性可以分为时间异质性和空间异质性：
时间异质性，指随着一段时间，如患者接受了其他药物治疗等，会出现耐药突变等情况，所以两次不一样也是正常的；
空间异质性，两次不同的取样部位，同一部位不同的组织，肿瘤细胞含量可能差距大，检测结果也会不一致。
时间异质性
刚刚确诊的肿瘤患者和已经经过一段时间靶向治疗的肿瘤患者基因检测结果可能会不同，这是由于靶向药物精准、高效地针对致癌基因异常表达进行阻断，在使肿瘤细胞逐步减少的同时，也伴随着致癌基因突变的降低，甚至是消失[1]。因此，会出现不同时期的肿瘤患者基因检测结果相差甚远的结果。
基因突变从有到无
基因突变从有到无可能提示两种截然不同的结果：
1、短期内靶点消失提示肿瘤患者靶向治疗的预后效果良好
2019年的一项回顾性研究在初始检出EGFR突变的42例患者中，使用靶药吉非替尼治疗2个月后，仅在6/42患者中检出了先前突变，患者突变的消失率达到了85.71%（36/42），后续随访也发现，EGFR突变持续存在的6名患者中位无进展生存期为16.25个月，而突变消失的患者中位无进展生存期为21.1个月[3]。
2、治疗后靶点消失提示耐药
很多患者在靶向治疗后，出现突变靶点消失，从而导致靶向药物作用无处发挥。
2018年发布的一项研究，评估了EGFR T790M突变肺癌患者采用奥希替尼治疗后，突变是否消失与生存期的关系。研究结果显示，经奥希替尼治疗耐药的肺癌患者中，突变消失具有显著更短的无进展生存期[4]。
基因突变从无到有
众所周知，具有相关基因突变，可采用靶向治疗的效果，生存期更长，生存质量也相对更高。
但不少患者在基因检测后排除可用基因检测的可能性，只能采用放化疗等传统治疗手段，预后效果不佳。那么，一段时间后，基因突变可以从无到有吗？能否燃起癌症患者采用靶向治疗的希望呢？
2019年的一项研究给出了答案。研究指出，放化疗药物会导致细胞中DNA损伤以及基因突变，诸如铂类、氟尿嘧啶等化疗药物会大幅加快DNA突变频率[5]。
另一方面，一些癌症患者虽然采用了靶向治疗，但仍有耐药可能。对于已经耐药的癌症患者，是否还有机会获得新的基因突变，重新开展靶向治疗呢？
答案也是肯定的。
以肺癌为例，对EGFR-TKI获得性耐药的非小细胞肺癌往往有c-MET的扩增和过表达，提示c-MET的扩增和过表达是EGFR TKIs耐药的机制之一。已有研究证实，针对MET改变进行靶向治疗，可以延长肺癌患者的生存期。
2022年世界肺癌大会（WCLC）中，研究人员公布了MET抑制剂赛沃替尼（Savolitinib）联合第三代EGFR酪氨酸激酶抑制剂奥希替尼（Osimertinib）治疗非小细胞肺癌的效果。研究结果显示，在所有的患者中，客观缓解率（ORR）为32%，中位缓解持续时间为8.3个月，中位无进展生存期为5.3个月。在高MET突变水平的患者中（n=108），客观缓解率为49%，中位缓解持续时间为9.3个月，中位无进展生存期为7.1个月[6]。
基因突变从有到有
研究表明，携带EGFR敏感突变的肺癌患者在靶向药物治疗后也会出现不同敏感突变亚型的转换。
2018年的一项研究显示，肺癌患者靶向治疗前和进展后EGFR基因突变不一致率为63.9%（39/61），EGFR变化类型有野生型变为突变型（4.9%）、突变消失（8.2%）、突变种类增加（49.1%）、还有3例患者发生了敏感突变之间的转换，分别表现为L858R和19Del相互转换、L858R转换为L858R+19del复合突变、19del转换为L858R+19del复合突变[7]。
空间异质性
肿瘤空间异质性广泛存在于几乎所有的肿瘤患者中，导致患者不同部位取材检出不同变异结果，也会导致明明检出相同突变的不同患者对同一药物效果的千差万别。
如下图所示，从根部开始，一个正常细胞先获取了突变A，然后细胞继续分裂生长，变成了三个细胞，其中一个又获得了突变B，一个有了突变C，一个有了T790M突变，这时，三个分支就开始独立进化了。结果就是同一棵树上，有着迥然不同的几个分支。
如果所有的分支都具有开始产生的突变A，因此，A突变就叫“主干突变”。相对应的，其它的突变都是后来独立进化出来的，只存在于某些分支上，它们就叫“分支突变”。因此，如果查出的突变只是“分支突变”，即使采用靶向药物治疗，也只能砍掉枝丫，却无法砍倒大树。
因此，虽然靶向治疗初期“分支突变”的肿瘤缩小，但其他肿瘤分支却不受影响，所以，很快肿瘤又长大了，出现了临床的“耐药”。其实很多时候，并不是肿瘤细胞进化出了耐药性，而是一开始，某些细胞就是耐药的。
除此之外，送检样本不同（通常组织样本比血液样本检测的准确度更高）、检测范围不同，也会导致结果不一致。
总的来说，如果短时间内连续获得两个不一致的基因检测结果时，可以倾向于以有突变的结果为准；现有的靶向治疗耐药后，也可以考虑再次进行基因检测，以评估是否有再次靶向治疗的可能。
但是肿瘤治疗存在个体化差异，效果也不尽相同，并不是所有的患者都适用于靶向治疗，也不是所有的患者都可以通过靶向治疗获益。
因此，在面对多次基因检测结果不一致的情况下，应该找到专业的肿瘤专家来进行综合判断，并遵循医生的建议。