什么是甲基化检测
甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。我们常说的甲基化检测针对的是DNA甲基化。
DNA甲基化是真核细胞的修饰方式，也是哺乳动物基因的主要表观遗传学形式，是指S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体，在DNA甲基转移酶催化下，胞嘧啶环上5′位置的氢被活性甲基所取代，转变成5-甲基胞嘧啶(5mC)。DNA甲基化通常抑制基因表达，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。DNA的甲基化一般发生在CpG位点，基因启动子及其附近区域内CpG的甲基化是基因实现沉默和基因印记的重要途径。
甲基化检测特点
通过亚硫酸氢盐预处理法进行的DNA甲基化检测与分析是目前的主流方法，常用的有甲基化特异性数字PCR(methylation specific PCR, MS-PCR)、核酸质谱、甲基化芯片等。基于PCR扩增的亚硫酸氢盐预处理法不需要昂贵的设备，方法简便易行，有基因扩增室的单位都能开展。
DNA甲基化检测样本易于从组织、血液、尿液、胸腹水和痰液中获得，检测方法具有灵敏度高、稳定性佳和成本低的特点，作为新型的生物标志物被广泛应用于各种恶性肿瘤的早期诊断，包括肺癌、消化道肿瘤、胶质瘤和妇科肿瘤等。DNA甲基化结合其他临床诊断指标，在恶性肿瘤的诊断中发挥越来越重要的作用。
检测技术的临床应用
这种甲基化分布的改变，导致了肿瘤抑癌基因的表达受抑制，并伴随着原癌基因表达的增加，从而进一步推动了肿瘤的发生、发展，这也成为DNA甲基化与癌症之间重要的纽带。研究结果也显示：基因甲基化的检测更适合于作为癌症早筛标记物。
目前为止，已有明确研究表明DNA甲基化可用于乳腺癌、结肠癌、肝癌、胃癌、肺癌、胶质瘤等肿瘤的诊断，准确率高达95%，在协助妇科肿瘤的诊断上也显示了很好的应用前景，这些进展为肿瘤的早筛和预防提供了新方法。
液体活检血液标本被证明含有肿瘤的遗传物质且可以被检测，循环肿瘤DNA(ctDNA)的突变谱已被证明与相应肿瘤组织相匹配，具有针对肿瘤的精准诊断价值。通过液体活检进行多癌种早期筛查和风险评估是DNA甲基化检测的重要应用领域之一。
国际进展
测序巨头Illumina公司旗下GRAIL公司在2021年美国临床肿瘤年会(American Society of Clinical Oncology, ASCO)年度大会上公布了其用于多癌种早筛产品Galleri的初步结果。Galleri是一项基于血液cfDNA靶向甲基化检测的分析方法，可检测、区分临床分期的50多种癌症类型,检测多种癌症的同时可识别其起源的组织。
在5000多例的检测样本中，Galleri的总体检测灵敏度为51.5%。随着癌症患者临床分期的升级Galleri的灵敏度也稳步提升，其 Ⅰ 期患者检测灵敏度为17%，Ⅱ期为40%，Ⅲ期为77%，Ⅳ期为90%，其检测的特异性最终达到99.4%。此外，Galleri对于癌症的组织溯源定位非常的精准，可达到88.7%的准确性。我国也有多家同行公司开发类似的血液早筛产品并已取得不少进展。
国内发展
截至目前，国家临检中心公布的《全国 Septin9 基因甲基化检测室间质量评价预研结果报告》中，共计60家实验室反馈有效的Septin9基因甲基化检测质评结果；器审中心已公开发布11篇甲基化产品审评报告；截至2023年12月20日，已有25款甲基化产品获批，其中包含21款试剂盒及4款软件；标管中心公示1项甲基化国家参考品；通过人遗办采集审批进入临床试验阶段的甲基化产品也已有64项。
截至目前，上海、北京、广东、广西、河北、辽宁、海南、重庆、安徽以及河南等地都公布了基因甲基化检测的项目编码，这也预示着基因甲基化检测在临床的应用愈发成熟。
正如解放军总医院呼吸与危重症医学部陈良安主任在《早期肺癌诊断中国专家共识》中所说：“DNA 甲基化是癌症早期诊断的理想生物标志物”。
结语
肿瘤基因甲基化检测是一种新兴的、具有前景的医学技术。它可以通过检测肿瘤组织中的DNA甲基化水平来评估肿瘤的发展状况和预后。
目前，肿瘤基因甲基化检测已经广泛应用于临床诊断和疾病监测，帮助医生评估疾病的进展情况，并给出合适的治疗方案。此外，这项技术还有助于研究肿瘤发生和发展的分子机制，为肿瘤预防和治疗提供重要的信息。随着技术的不断提高和普及，肿瘤基因甲基化检测的市场前景非常光明。
预计未来几年内，这项技术将得到进一步普及和应用，为患者提供更好的诊断和治疗方案。总的来说，肿瘤基因甲基化检测具有巨大的潜力，有望成为肿瘤诊断和治疗的重要工具。
目前，中国的肿瘤基因甲基化检测市场面临着一些挑战，如技术水平不一、标准不统一、产品质量参差不齐等。因此，市场需要更多的监管和规范，以确保检测结果的可靠性和准确性。
总的来说，中国肿瘤基因甲基化检测市场具有广阔的前景，并有望继续保持快速增长。与此同时，也需要提高行业的整体水平，以更好地服务患者的需求和需要。
2024，甲基化检测，下一个风口！