1.1 按照部位分类
分为组织样本、血液样本和恶性渗出液样本。
①组织样本
组织样本包括FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）样本和新鲜组织。FFPE样本包括蜡块和石蜡切片（白片和卷片）。
组织样本的取样方式有穿刺和手术。
②血液样本
血液样本检测包括WBC（白细胞）检测和血浆中cfDNA检测。
③恶性渗出液样本
恶性渗出液的取样部位包括胸、腹水（上清和沉淀包埋）、心包积液和脑脊液。
1.2 按照DNA样本类型分类
分为gDNA、cfDNA和Total RNA。
①gDNA
Genomic DNA（基因组DNA），指有机体在单倍体状态下的DNA全部含量，通过组织提取、全血、WBC提取、胸腹水沉渣包埋可以获得。
②cfDNA
Circulating free DNA（血浆游离DNA），血浆（外周血）中游离存在的不包含在完整细胞结构内的DNA，从血浆提取，恶性渗出液上清提取得到。
循环肿瘤DNA（ct DNA）：来自于坏死或凋亡的肿瘤细胞，或来自于肿瘤细胞分泌的外泌体，是人体血液循环系统中不断流动的，携带一定特征（突变，插入，缺失，拷贝数异常、甲基化等）的来自肿瘤基因组的DNA片段。在血液中的含量极低，约占整个cfDNA的0.01%-1%。
③Total RNA
总RNA，包含了细胞中的全部RNA（mRNA、rRNA、tRNA等），从组织提取、胸腹水沉渣包埋中获取。
2、肿瘤NGS常见样本的采集要求
2.1 组织样本（FFPE）样本采集要求
白片/卷片厚度4-5μm, 手术组织15片，穿刺活检组织25片（片数不绝对，可根据组织大小适当增减）。烤片时间控制在10-15分钟。
手术有多个蜡块保存时，应选择肿瘤细胞含量高的蜡块/切片送检，送检蜡块最好为1年以内制作保存。
2.2 全血样本（WBC提取）要求
为防止对下游提取过程产生影响，血液采集管应尽量使用EDTA抗凝管或柠檬酸钠抗凝管，肝素抗凝管会对下游实验的酶产生抑制。
保存时间：2-8℃保存一周，-20℃保存一个月，-70℃长期保存。-20℃保存样本，抽提前应37℃水浴溶解（防止纤维蛋白生成影响提取），样本抽提前需充分混匀。
2.3 血浆样本（提取cf DNA）要求
采血应为术前，术后患者ctDNA含量会迅速下降。化疗初用药时也会影响ctDNA含量。
EDTA抗凝管采集：离体后两小时内进行分离，最长不超过4h。cf DNA采血管：常温下7天内进行血浆分离。
采样量尽量8-10mL，2管，勿剧烈震动，避免溶血。样本与溶血比色卡比对，溶血程度需≤4。